Sejarah Petron bermula pada 7 September 1933 apabila Socony Vacuum Oil Company of New York dan Standard Oil of New Jersey membentuk Vacuum Standard Oil Company (Stanvac). Akhir usaha di awal 1960-an berpecah pemasaran dan penapisan kepentingan syarikat di antara Mobil (Socony Vacuum yang dinamai Oil Company) dan Esso (yang dinamai Standard Oil New Jersey, tidak lama lagi untuk menjadi Exxon), dengan cawangan Filipina yang kini dinamakan Esso Filipina, dengan pejabat di Manila dan kemudian di Makati.

Pada tahun 1953, kerajaan negara Filipina, sebahagiannya untuk mempromosikan program perindustrian negara Claro M. Recto dan sebahagiannya untuk bertindak balas terhadap kenaikan harga minyak antarabangsa, cuba untuk melancarkan syarikat minyak negara yang memenuhi pengguna Filipina dengan minyak murah. FilOil, syarikat minyak Filipina yang pertama telah ditubuhkan sebagai hasilnya.

Pada tahun 1973, Esso menjual perniagaan kepada kerajaan yang menjadi Syarikat Minyak Kebangsaan Filipina (PNOC). Selepas itu, Mobil juga dijual bahagiannya daripada kilang penapisan ini PNOC.

Penapisan dan pemasaran minyak unit pada PNOC, bersama-sama dengan FilOil, akhirnya bergabung untuk membentuk Petrophil, yang kemudiannya ditukar nama kepada Petron pada tahun 1988. Hari ini pendapatan industri syarikat itu tidak pernah melihat keuntungan yang tinggi tetapi masih diniagakan dalam hasil global purata.

Nama Petron digunakan untuk menjadi satu jenama petrol Petrophil. Dilancarkan pada tahun 1974, nama itu datang dari petroleum (PET) dan bilangan penyelidikan oktana (RON).[5]

Sebagai sebahagian daripada program penswastaan ​​kerajaan, PNOC dicari rakan strategik yang akan memberi Petron bekalan yang boleh dipercayai minyak, serta akses kepada teknologi penapisan canggih. Hasilnya adalah satu perkongsian dengan pengeluar minyak terbesar di dunia, Saudi Aramco.

Pada 3 Februari 1994, PNOC dan Aramco Overseas Co. BV menandatangani perjanjian pembelian saham yang memberi kedua-dua kepentingan 40% dalam Petron. Baki 20% daripada saham Petron telah dijual kepada orang ramai.

Pada 11 Ogos 2006, sebuah kapal tangki minyak Petron, Suria 1, yang membawa minyak bahan api tenggelam, menyebabkan tumpahan minyak Guimaras, tumpahan minyak yang terbesar dalam sejarah Filipina.

Pada awal tahun 2008, PNOC dan Saudi Aramco masing-masing memiliki 40% daripada saham yang cemerlang, dengan 20% selebihnya dipegang oleh beribu-ribu pemegang saham individu. Pada tahun 2008, Saudi Aramco menjual semua kepentingannya kepada Kumpulan Ashmore, kumpulan pelaburan yang disenaraikan di London. Kemudian Ashmore ditambah 11 peratus lebih apabila ia membuat tawaran tender yang diperlukan untuk pemegang saham lain, untuk sejumlah pegangan 51 peratus. Sehingga Julai 2008, Ashmore, menerusi anak syarikat SEA Refinery Holdings BV, mempunyai 50,57 peratus daripada saham Petron. [6] Bayaran Ashmore dijalankan pada Disember 2008. [7] Pada Disember 2008, Ashmore memperoleh 40 peratus pegangan PNOC ini. Pada Disember 2008, San Miguel Corporation berkata ia kini di peringkat akhir rundingan dengan Kumpulan Ashmore untuk membeli sehingga 50.1 peratus daripada Petron.[8]

Pada 30 Mac, 2012, Petron mengambil alih perniagaan hiliran ExxonMobil di Malaysia dengan XCEL Petroleum. Pada Januari 2013, Petron dibuka secara rasmi operasi mereka di Malaysia, penjenamaan semula semua stesen Esso dan Mobil di seluruh Semenanjung Malaysia.[9]